Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PACSIN1Q9BY11 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms