Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2AFJQ9BTM1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms