Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAGR1Q9BTK6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAGR1Q9BTK6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms