Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINGO1Q96FE5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms