Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms