Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
COPS9Q8WXC6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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