Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ZNF548Q8NEK5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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