Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TTC16Q8NEE8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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TTC16Q8NEE8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC16Q8NEE8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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TTC16Q8NEE8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TTC16Q8NEE8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TTC16Q8NEE8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TTC16Q8NEE8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TTC16Q8NEE8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TTC16Q8NEE8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TTC16Q8NEE8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TTC16Q8NEE8 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTC16Q8NEE8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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