Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms