Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDXQ7Z353 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDXQ7Z353 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms