Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms