Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms