Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGSNQ5TDP6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms