Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C9orf50Q5SZB4 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf50Q5SZB4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf50Q5SZB4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf50Q5SZB4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf50Q5SZB4 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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