Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCID2Q5JVF3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCID2Q5JVF3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms