Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFT2D3Q587I9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms