Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms