Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MSMPQ1L6U9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms