Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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