Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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FXNQ16595 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FXNQ16595 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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