Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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GRIK5Q16478 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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