Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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