Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TWIST1Q15672 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms