Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms