Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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CBFBQ13951 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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CBFBQ13951 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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