Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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