Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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