Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEUROD1Q13562 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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