Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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