Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CBX3Q13185 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CBX3Q13185 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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