Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BNIP1Q12981 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BNIP1Q12981 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms