Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BPTFQ12830 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BPTFQ12830 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BPTFQ12830 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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