Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CD164Q04900 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CD164Q04900 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms