Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms