Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNC1Q01954 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms