Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms