Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBB4BP68371 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms