Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MCCD1P59942 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms