Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms