Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSEN1P49768 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms