Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI2P48788 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms