Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ME1P48163 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ME1P48163 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms