Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms