Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA7P31268 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms