Protein–RNA interactions for Protein: P30305

CDC25B, M-phase inducer phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25BP30305 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC25BP30305 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC25BP30305 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms