Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms