Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRB3P28472 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms