Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTSLP07711 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTSLP07711 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTSLP07711 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms