Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms