Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms